Od pierwszej edycji imprezy na trasę Cracovia Maraton wyruszają zawodnicy z niepełnosprawnościami rywalizujący na wózkach. Dostępność i inkluzywność to zagadnienia, które leżą u podstaw organizacji biegu. Cracovia maraton jest zaprojektowany i organizowany z myślą o różnych potrzebach i możliwościach uczestników, w sposób gwarantujący możliwość udziału także osobom z niepełnosprawnościami. Do Krakowa przyjeżdża najliczniejsza w Polsce grupa sportowców startujących w kategoriach hand bike, rim push i active wheelchair. Wózkarze rywalizują na tej samej trasie co biegacze, natomiast ich start odbywa się wcześniej.